数据库是用来存储蜜蜂、树苗、蝴蝶等带基因物品的容器。最多能存储136种不同类型的物品，同时配有搜索栏。打开数据库的GUI如图所示：

当玩家持有便携式多用分析仪时，点击分析仪图标可打开如下界面，若分析仪内装有蜂蜜滴，可直接点击显微镜图标分析数据库内的蜜蜂、树苗或蝴蝶的基因和详细信息，并消耗一个蜂蜜滴。数据库可当做是一个集林业员箱子、养蜂人箱子、鳞翅目昆虫学家箱子于一体的箱子使用。

注意：合成该物品所需的箱子可替换为本模组中的林业员箱子、养蜂人箱子、鳞翅目昆虫学家箱子任意一种。