飞行石晶体自然生成在天空之城结构内，由底座和上面的八面体形状的晶体构成，底座无法被挖掘，实体可以穿过晶体。

飞行石晶体被红石信号激活时，会给半径 100 格球形区域内的玩家施加神圣城堡效果，使玩家无法放置和破坏任何方块。与此同时，底座会发出亮度为 15 级的光，底座上方的晶体会飘浮并逆时针旋转。切断红石信号输入会使晶体停止工作。

当玩家在天空之城里初次找到飞行石晶体时，需要站在它的底座上才能获得进度。