比较所用的匠魂3版本为3.5.3.88，游戏版本1.18.2。
将原匠魂宝典拆为6本，出生时附带1本材料与你。6本指导书分别写有不同等级的材料和游戏内容。
工具
移除：铲（有附属）、长剑、西洋剑、煎锅、战斗牌子（开发中）、回旋镖、短弓（有附属）、箭矢、弩箭。
新增：匕首（可放在副手右键攻击）、板斧（纵向连锁砍树、剥皮，攻击伤害非常高）、矿脉锤（小范围连锁采集）。
未来会新增：Spear（矛，相当于三叉戟）、Boomerang（回旋镖，真的可以回旋）。
矿物
移除：阿迪特。
新增：铜（1.18中被原版铜取代，主世界不再生成任何匠魂矿物）。
要知道，虽然匠魂2支持铜、银等多种金属，但本身没有“生成”他们。
制作
模具加工台被移除。
（一次性）黏土铸模被移除，改用沙子/红沙铸模，（多次性）金质铸模保留。
部分材料只能用于制作绑定结。
工匠砧（工具装配台）需要使用合金块不是下界合金块进行合成，而非任何金属块。
熔冶
多方块：新增熔化炉、合金炉、熔铸炉；移除焦黑熔炉和工匠储罐。
熔化炉中熔炼矿物时，熔炼粗矿（包括远古残骸）可获得1锭3粒的对应熔融金属（粗块翻9倍）、熔炼金属矿石可获得2锭6粒的对应熔融金属，熔炼宝石矿石（包括紫水晶簇）可获得2宝石的对应熔融宝石，熔炼砖泥可获得2砖的对应熔石。熔化炉的容量只有1080mB，且每个熔化炉中只能存在一种流体。炉中流体可通过浇注口输出。
冶炼炉的冶炼增产改为了熔化炉的熔炼增产。冶炼炉合金与实体熔炼现在也会消耗燃料。
合金炉无法对金属进行熔冶，只能提取相邻流体储罐内的液体进行合金，合金后的熔融合金会保留于合金炉内，可通过浇注口输出。
熔铸炉熔铸粗矿与矿石不会有增产，不过会有副产物。熔铸上限视搭建的大小而定。熔铸炉是唯一能一次融化出多种液体的熔炉，例如你可以将焦黑储罐熔炼成8锭焦黑炉砖和1块玻璃。熔铸炉内的流体不会合金。
在制作冶炼炉之前，需要先制作熔化炉（微缩冶炼炉），使用熔化炉融化一些铜并对焦黑砖块进行浇注，才能获得搭建冶炼炉所需的冶炼炉控制器。
熔化炉和合金炉的使用方式可参考“匠魂补充 ”，这是一个匠魂2的附属模组，作者是匠魂2、3的作者之一。
部分合金需要更高的温度才能进行合金，需要比熔岩更高温的燃料（烈焰血）。
装备
旅行者套装 ：材料成本低，适合前期使用。
镶板套装：护甲值高，防御槽较多。
黏液套装 ：由末影黏液和浇注一些生物的肢体获得，可以给玩家带来一些特殊的能力。除黏液头颅外，不提供任何护甲值，有大量升级槽。
强化
强化分为五种：升级、能力、防御、灵魂（暂无作用）和无槽位强化。
升级：小型工具初始3个，大型工具初始2个，最终最高可达14个。
能力：所有工具初始1个，后续可额外增加1个。
防御：适用于盔甲或盾牌上的强化。
灵魂：暂无具体作用。
毎种强化分别拥有各自的强化方式，具体见强化槽。
杂项
黏液岛（史莱姆岛）、黏树（史莱姆树）大改。
新增两种灯笼焦黑灯笼和焦褐灯笼，可自行注入液体，产生不同的颜色和亮度。
更多生物头颅（如洞穴蜘蛛、尸壳）。
另：匠魂3已有与其他科技模组的联动，主要表现为更多的材料。
至于新材料、新配方、新升级、新属性计算的特性，还请各位玩家在游玩过程中自行探索。
