自神秘农业更新至1.14后版本号就变成了2.0.0，内容和玩法上也是大改。自此以后神秘农业的玩法并没有较大的改动，故本教程除另有说明外适用于所有2.0.0+的版本。

世界生成

主世界两种矿石（下级精华矿石和活化水晶矿石）并无改动，但是它们在下界和末地生成的变种已经被迁移到神秘农业扩展模组中。此外，离魂沙的获取方式从使用下级离魂沙合成改为挖掘新增的离魂矿石掉落获得。

如图，这种夹杂在下界的离魂石团簇中的矿石就是离魂矿石。顺带一提，现在在熔炉中烧制离魂石获得的是离魂平滑石头，再次烧制才能获得下级离魂沙。

作物与精华

神秘农业的核心始终是“种矿”，所以作物和精华的变化不大。值得一提的是守卫者作物改为海晶作物，除下级精华作物外其它等级的精华作物全部被移除。此外元素类作物的层级从“1”改为一个新的层级‘元素”（只是改个说法而已，本质还是层级为“1”）。随后每个版本都为原版增加了新的种子和对应精华：

1.14+新增珊瑚作物，海龟作物，鱿鱼作物，鱼作物

1.15+新增蜂蜜作物

1.16+新增下界合金作物

1.18+新增紫水晶作物和深板岩作物

种子的获取

这次更新最大的变化就是种子的获取，首先所有作物被分为资源类和生物类两大类，资源类作物的种子需要以活化种子基底为基础合成，而生物类作物的种子需要以离魂种子基底为基础合成。

合成的方式也从工作台改为使用注魔祭坛合成，需要由一个注魔祭坛方块和八个注魔基座摆成。然后右击或使用漏斗和管道等将物品摆在注魔祭坛方块或注魔基座上。

配方还是老样子，中间（注魔祭坛方块）放上对应的基底种子，四个角（注魔基座）放上对应层级的精华（如层级为5则放入相应的终极精华，层级为元素的就使用初级精华），剩余的四个格子9注魔基座）放上对应的物品（资源类作物需要对应的物品等，生物类作物需要装满对应灵魂的灵魂瓶，经验作物需要装满的经验胶囊）。

配方摆好后，给予注魔祭坛方块红石信号即可开始合成。

特殊合成材料

使用离魂匕首击杀生物时，玩家身上的灵魂瓶就会收集其灵魂，集满后即可用于合成。不同生物的灵魂装满其灵魂瓶需要的数量不同。在工作台合成一次可清空其中的灵魂。

吸取经验球时，经验会自动装入玩家身上的经验胶囊中（优先级：经验胶囊＞经验修补附魔＞玩家吸收），积满1200点经验值后即可用于合成。

种子的增值与精华耕地

获取更多的种子变得更加困难，每种层级都新增了对应的精华耕地：

所有精华作物种植在原版和其它模组的耕地上时收割不会掉落第二个种子，只有种植在精华耕地上才会掉落额外的种子。

作物种植在任意层级的精华耕地上时有10%概率掉落第二个种子，种植在对应层级的精华耕地上时有20%概率掉落第二个种子。（例如将层级为2的自然作物种植在同样为2级的初级耕地上。）

下级精华作物和种植在精华耕地上时有几率掉落更多的精华，精华耕地层级越高概率与数量越大。

精华耕地与原版耕地类似，同样需要水浸润（浸润后颜色也会变深）。当精华耕地被没有缓降效果的生物踩踏，长时间没有种植作物也没有被水浸润或在精华耕地上放置不透明的方块均会导致精华耕地变为泥土。挖掘后掉落泥土（使用带有精准采集附魔的工具挖掘则掉落本身）。除合成外，亦可使用精华直接右击耕地使其变为对应的精华耕地。

工具/盔甲和魔符

工具和盔甲并无太大改动，只是删除了钓鱼竿和剪刀，穿齐整套盔甲不再有套装奖励，合成配方中删除了精华工具核心，改为使用上一级的工具/盔甲与该层级的精华锭和精华宝石（精华+活化宝石合成）在工作台中一级一级的合成而来。

魔符系统改动较大，首先魔符改为升级，需要使用空白升级和对应材料，精华在注魔祭坛中合成，有多个等级的升级需要由上一级的升级一层一层的合成而来。升级可以直接在工具装配台中安装，不再需要额外的活化水晶碎片等。同一工具/盔甲仍然像1.12时那样只有一个可用的升级槽。

其它改动

新增指南书，需要帕秋莉手册支持。

洒水壶的合成配方中删除了虚拟无限水源，且合成出来后需要右击水源方块一次来装水（装水后即可永久使用，无需再次装水）。每次浇水后会进入短暂的冷却时间。

种子再处理器需要消耗熔炉燃料才能工作。

每种层级都新增了对应的生长加速器，除范围不同以外无任何区别。

离魂玻璃的合成配方中的灵魂沙改为下级离魂沙。