高级炼金冷凝器是炼金冷凝器的升级版本，使用原理相似，但它们有一些关键的区别。首先，它需要三个高级炼金蒸馏器来配合操作。三个分别放置在冷凝器左右侧和后侧。

高级冷凝器可以制取最多三种成分的药剂，也可配合改性剂来改变药剂性质。改性剂可以有选择性的添加到大部分配方中来改变药剂的某些性状。在高级冷凝器的GUI中，改性剂放置在燃料槽的正上方的槽中。以及区别于基础的三个成分配料槽。

最后，高级冷凝器比基础冷凝器运行更快，可以在基础冷凝器制取的药剂同样能在高级冷凝器中制作。

高级炼金冷凝器的配件，每个冷凝器需要三个蒸馏器。

使用时需分别放置在冷凝器左右侧和后侧，蒸馏器必须与冷凝器材质相连。